Tras la abolición del grupo B en 1986 y abandonar el campeonato del Mundo de Rallys, Peugeot decidía volver a la máxima categoría con un vehículo de tracción total 11 años después. No sería hasta 1997, cuando el departamento de competición se ponía manos a la obra para desarrollar un vehículo bajo la reglamentación Word Rally Car. El modelo elegido fue el 206, un modelo que se empezaba a comercializar en septiembre de 1998 en el mercado.  La versión de competición WRC, se empezaba a construir ese mismo año, en el mes de marzo.

Entre los encargados de desarrollar el nuevo vehículo se encontraban algunos ingenieros de los años 80 que trabajaron en el desarrollo del 205 T16 Grupo B, como Jean Pierre Nicolás , jefe del proyecto de esta versión WRC. Nicolás contrato a Michael Nandan ,que trabajaba para Toyota en el Corolla WRC, Nandan se encargo de una parte muy importante del coche, los diferenciales electrónicos.

Para homologar el vehículo WRC, la marca tuvo que comercializar una versión limitada de 2500 unidades denominada 206 GT. La FIA permitió que el nuevo 206 agrandara los parachoques delantero y trasero en su versión de calle para alcanzar la longitud mínima de 4metros requerida por la federación para cualquier auto WRC y así obtener la correspondiente homologación.

El 206 WRC era pura tecnología de última generación, con sistemas electrónicos que controlaban el coche y los diferenciales, y una inusual caja de cambios montada longitudinalmente detrás del motor en posición transversal. Peugeot construía un automóvil que prometía ser todo un éxito, incluso la propia marca desarrollo sus propios amortiguadores, mientras que PIPO fue el encargado de desarrollar y suministrar los motores.

Tras recibir la homologación FIA el 16 de abril de 1999 , Peugeot marcaba en el calendario una fecha para su debut, la 43º edición del Rally Tour de Corse era la prueba elegida, allí la marca del león presentaba dos flamantes y nuevos 206 WRC en línea de salida para Gilles Panizzi y François Delecour , ambos coches se mostraron muy prometedores en las retorcidas carreteras de la isla , incluso Delecour fue el más rápido en la especial número 7, pero lamentablemente los dos autos se vieron obligados a abandonar, pequeños problemas de juventud tanto eléctricos como mecánicos en un coche completamente nuevo en su primera participación.

El fabricante inicialmente se encontró algún que otro problema en varias sesiones de test, uno de ellos fueron las vibraciones del motor, que afectaban a la transmisión, sobre todo en la superficie de tierra, haciendo que la caja de cambios se rompiese, otro de los problemas fue el sobrecalentamiento del motor, llegando incluso a romper tres motores en una sola sesión de test..

Tras solventar los problemas y realizar una nueva e intensa jornada de test y 400 km sin sufrir ningún problema , el ágil Peugeot lograba ser fiable y se mostraba listo para competir al 100%. Su primer podio fue en el Rally de San Remo 99, segunda posición con Gilles Panizzi tras Makinen ( Mitsubishi )

El 206 WRC lograba 24 victorias en 76 carreras disputadas entre 1999 y 2003, dos campeonatos de pilotos con Marcus Grönholm (2000-2002) y tres consecutivos de constructores (2000-2001-2002) .

Estaba dotado de un motor de 4 cilindros en línea de 1998cc que lo llevaban a los 300cv de potencia con un peso por reglamentación de 1230kg. Inicialmente montaba una caja de cambios secuencial de 6 velocidades, siendo sustituida por una de cinco marchas en la tercera evolución del auto.
Fue un vehículo muy eficaz que lograba vencer en diez pruebas diferentes en el mundial de Rallys a lo largo de su historia, mostrándose sobre todo muy fuerte en la superficie de asfalto.